"Muitos anos depois que a titânica batalha contra Quartzmon determinou o destino de todos os universos, a Terra e o Digimundo estavam em paz, mas agora enfrenta um novo perigo...

Se há deuses e Anjos que protegem a vida e mantém a luz do seu lado neste universo, então também há deuses e Demônios que os causam mortes e tem as trevas ao seu lado.

O rei dos vampiros GranDracmon, que mantém o equilíbrio da Dark Área inteira, desperta de um longo sono. Uma vez desagradado, ele leva a destruição ao limite, e o seu despertar deixa tanto os três arcanjos quanto as 4 Bestas sagradas em pânico.

Enquanto isso um ser misterioso caça uma das únicas ameças que poderiam derrota-lo, os Digiescolhidos. Mas falha, ao saber que a maioria dos Digivaices já haviam sido enviadas para os humanos.

Tentado a já inciar seus planos, ele tenta coloca toda ilha arquivo e o continente Sarba sobre seu controle e apesar de confrontar diversos Digimons extremamente fortes, nenhum deles conseguiu derrotar o ser misterioso.

Em ato de extrema arrogância, ele manda um aviso para todo o Digimundo:

'Espero que exista alguém na Terra mais digno de ser destruído'

Vendo que ameaça não somente engloba o Mundo Digital, as 4 bestas sagradas concordam em trazer humanos para que se junta-sem aos Digimons. Agora cabe os escolhidos deter essas duas ameaças que ameaçam suas vidas e as vidas de quem mais amam, mas o que fazer quando nem tudo parece ser o que é?

2025 - O lançamento de um novo jogo é o tema do momento, jornais, revistas e todos os meios de comunicações só falam do novo DW Heroes e da ascensão do D-Soul. Jake um garoto de 14 anos que participou do teste beta volta ao mundo virtual pra viverem novas aventuras e tentar sair vivo. Tudo muda quando ele descobre que está preso no jogo em que tanto ama e com a ajuda de seus amigos tenta sair vivo e achar o culpado