Na era moderna, a tecnologia atinge patamares nunca antes vistos. Contudo, como a história sempre revela, um mundo em constante avanço apenas desvendará novas questões e mistérios. Koji Tsurugi e seus amigos estão prestes a enfrentar uma série de problemas e desafios à medida que criaturas inéditas, conhecidas como "Digimons", surgem em massa no mundo humano.

Entretanto, Koji está longe de perceber que ele desempenha um papel crucial no maior mistério que se desenrola em segundo plano. Sem o seu conhecimento, ele torna-se peça fundamental em um intrigante jogo cósmico.