Ah , o destino ... As vezes o destino nos reserva experiência que nunca pensamos vivenciar em nossas vidas. As vezes os únicos capazes de decidir oque vamos vivenciar ou quem vamos conhecer ao longo de nossa jornada somos nós mesmo , no entanto , as vezes o destino aparenta conspirar contra nós , de tal forma que somos incapazes de evitar nosso destino. Hoje lhes contarei uma história sobre quatro duelistas , que apesar de suas enormes diferenças entre si e o enorme contraste entre seus objetivos , acabam vendo-se obrigados a se unir e lutar por algo que nunca imaginaram em suas vidas ...

Após uma intensa guerra civil que ocorrida entre a Academia , os duelistas da dimensão Fusion , a City , os duelistas da dimensão Synchro , Heartland , os duelistas da dimensão XYZ , e por fim , Standard , os duelistas que fazem intermédio entre todas as dimensões além de serem capazes de usar todos os tipos de invocação , seus respectivos líderes (Judai Yuki , Fudo Yusei , Tsukumo Yuma e Muto Yugi) , instituíram um acordo que não só proibia o uso dos duelos em nome da violência , como também , levou a criação de institutos especializados em treinar duelistas para o circuito profissional , com isso , todos os anos milhares de jovens de todas as dimensões vem para uma das maiores academias de duelo localizada na dimensão Standard , a Neo Duel Academy com um único objetivo: Estarem entre os maiores duelistas do circuito profissional , então , vamos lá duelistas , é hora do duelo !