Em Mobius, Sonic vive triste. Passou-se dois anos desde que teve sua ultima aventura (Sonic Lost World). Desde aquele tempo, seus amigos se convenceram de que ele usava sua ajuda para ganhar mais popularidade e se afastam do ouriço. Eggman, ao perceber sua fraqueza emocional, tenta traze-lo ao seu lado. Mas comete um erro terrível, que traz um inimigo muito mais perigoso... Dark Super Sonic.