Dessa vez o grande "VILÃO" é Baxter Stockman, que arma um plano pra tentar enganar a equipe e usa a gangue Dragões Roxos pra cometer furtos! E adivinha quem acaba achando o covil do "vilão"... Os Dois que não se suportam: Tamara e Raphael!!

Os meninos de TMNT, são humanos. Estudam, fazem coisas de adolescentes normais de dia e são ninjas a noite. Eles acabam conhecendo na escola; Verônica, Tamara, Raytell e Nancy. Que parecem meninas normais, mas acabam descobrindo que elas também são ninjas!