"Quando a Luz e a Escuridão, a Ordem e o Caos deixam de ser unos e passam a ser opostos, o Fulgiston, a grande espiral viva dá origem aquilo que conhecemos hoje como Universo. Das entranhas da Espiral dos Tempos e Infinitos, dimensões, galáxias, sistemas, constelações, planetas ganham vida e fluem pelo Infinito e Além obscuro e inalcançável a qualquer entidade. Tempos de harmonia regeram o Universos por incontáveis eras. O equilíbrio perfeito. Yahweh, Deus da Luz e da Ordem e Tehom, Deusa da Escuridão e do Caos, coexistiram juntos, porém opostos. A Escuridão com seus deuses e entidades malignas e a Luz com seus Arcanjos e anjos. Um guerra foi travada e a Luz sobrepôs e Escuridão pondo um fim ao Caos. E o equilíbrio do Universo fundou-se em um único pilar.

O Senhor da Luz, não ainda satisfeito deu origem um novo Sistema, como novas criaturas, um "Jardim" pessoal e incumbiu suas criaturas aladas originadas de sua resplandecência, os celestes, a proteger, cuidar, guiar eternamente sua mais nova criação, portadores da herança verdadeira, o Livre-Arbítrio,a Imortalidade da Alma: Os Humanos. Saciados de seus dias, o Criador adormeceu.

O Fulgiston, desapareceu.

Mas uma eternidade pode ser longa, pesarosa e dolorosa demais aos humanos. E um fardo para aqueles que foram incumbidos de proteger os Herdeiros de Deus. A Palavra Sagrada foi distorcida e usada pelos Primicérios do Criador, os Arcanjos, para justificar sua ira e ódio contra os humanos. Uma nova guerra foi iniciada. Não entre anjos e demônios, nem contra deuses. A batalha era contra os humanos.

Os céus foram divididos, nem todos celestes agiram de acordo com os Primicérios. Ocorreu a cisão.

O dia foi marcado.

O Principio do Fim..."

A história se passa numa época de grande evolução e desenvolvimento das máquinas na sociedade humana. Onde homem domina a máquina. O maior feito entre todos os tempos, um ser meio homem meio máquina, uma criatura híbrida, onde sua aparência física é idêntica ao de um humano, mas seu sistema ósseo e neural é inteiramente computadorizado, sendo feito de uma complexa estrutura metálica, denominado Arcadian.

Mas um grande acidente acontece na empresa pioneira em produzir arcadians, Abstergo Corporation, onde uma de suas principais cientistas, Rilla Yamanaka, está desaparecida e é a principal suspeita do acidente, que gerou conseqüências a civilização. A vida de Rilla muda bruscamente depois desse acidente. Durante a explosão Rilla se fere gravemente, quando desperta da explosão quase é morta por um arcadian descontrolado, porém um homem misterioso a salva. Rilla ao finalmente despertar se encontra sozinha, mas o que ela não havia percebido foi que tinha passado por uma cirurgia, onde parte de seu corpo era uma máquina!

Abandonada, desolada e procurada, Rilla saí em busca do verdadeiro culpado do incidente a fim de provar sua inocência e daquele que a transformou e descobrir o porquê de sua transformação. Nesta jornada, Rilla é forçada a entrar no subconsciente de uma máquina para sobreviver e entender que as máquinas também são Humanas...