Três jovens são acusados de fazer um massacre na sua escola e a juíza, perante a carnificina, decide aplicar-lhes a pena de morte julgando-os como adultos na prisão de Fox River.
Dentro da prisão, os três rapazes descobrem o plano de fuga de Michael Scofield e decidem entrar no jogo.
Ao lingo do enredo vai-se descobrindo que o que aconteceu naquela escola não tinha sido bem o que parecia...