A Região de Hoenn, e repleta por pura grandeza e uma vasta felicidade entre seus habitantes, as batalhas antigas travadas entre os lendários Kyogre e Groundon foram devastadoras para o continente, mas com a ajuda de Rayquaza, o continente voltou ao normal, mas anos se passaram e novas tecnologias foram feitas, as pokebolas que eram somente para pessoas ricas, agora também poderá ser utilizada para aquela criança que estiver com a idade superior a 10 anos, essa e a historia das aventuras de Ruby. Um menino morador de Petalburg, uma cidade pacifica da região, com base nessas aventuras vai até o Laboratório do professor Birch e inicia a jornada com um grande parceiro, Castform. Logo após o inicio de sua jornada, tem uma grande missão lendária, Proteger Jirachi, custe oque custar.