A magia que vem vazando lentamente de outros mundos nos últimos catorze anos finalmente despertou. Com o pouso da nave interdimensional Dimension-1, muitas crianças mal sabem que as aulas estarão longe de ser seu maior desafio em Hogwarts.

Caos começa a se espalhar novamente no mundo mágico quando um grupo auto-nomeado como a ordem de Morgana começou a procurar sete jóias mágicas. Mas as joias escolheam seus donos entre sete crianças. Essa escolha vai virar suas vidas de cabeça para baixo, concedendo-lhes novos poderes, mas também trazendo grandes perigos.

A história narra a vida de Zane Truesdale, um garoto talentoso de uma cidade desconhecida do Japão.

Matheus era um garoto de 15 anos estudava numa escola de duelos chamada all-star com seus dois amigos luck e eddie.

Existiam Três dimensões diferentes, a dimensão da Fusão, a dimensão da Sincro e a dimensão da Xyz, todas elas entraram em conflito por um motivo desconhecido, assim, cada uma delas selecionou seus melhores duelistas para ir para a guerra de dimensões, mas a guerra não será somente entre as dimensões, virá algo pior, o verdadeiro motivo será esclarecido...

O famoso jogo de cartas monstros de duelo, aumentara sua popularidade de maneira absurda, com isso, diversas Academias de Duelo foram criadas.
Tyler é um jovem que fora selecionado para a Universidade de Duelos de South Town, nesta universidade, os duelistas eram obrigados a passar por uma prova rígida de admissão, apenas os melhores entravam!
Agora Tyler viverá seus próximos 3 anos na Universidade de Duelos de South Town!