Noah recebeu uma missão: se infiltrar no Tornei Gran-Poké e capturar Giovanni, líder da Equipe Rocket. Ela e seu fiel companheiro Pichu entram no torneio, mas logo percebem que não vai ser nada fácil chegar até o Líder. Além disso, um jovem misterioso, Lucca, e seu Shuppet parecem estar interessados no grande prêmio do torneio, o que vai dificultar e muito a missão de Noah.

Alice ainda lutava por suas memórias, e Oz sempre ficou ao seu lado. Gilbert, não muito feliz, os ajudava. Sharon e Break sempre tinham a coisa certa para fazer, na hora a certa. Will of Abyss, a Alyss, cada vez mais forte e sedenta por sangue, queria Oz e destruir Alice. Mas e quando tudo simplesmente virar de cabeça par abaixo? E Pandora: qual segredo por trás desta organização?