Após mais uma de suas máquinas ter saído do controle e atacado as pessoas de Mineral Town, Kindex foi banido da vila e agora tem que se virar em um mundo hostil e cheio de monstros! Ou não.

Um dia, todas as pessoas da terra se tornaram monstros, e os poucos que sobraram no mundo (cerca de 50) se tornaram Genasis e adquiriram poderes elementais e foram para lugares diferentes do mundo. Emily, uma Genasis do Ar mau-humorada e tsundere conhece em uma de suas viajens o jovem Neo, um garoto que não sabe usar poder algum e tem uma aptidão incrível para atrair monstros (e posteriormente se torna o "brinquedo" de Emily). Em um dia fatídico, todos os Genasis recebem um misterioso chamado para a cidade de Londres. Assim, começa a jornada dessa dupla que não tem nada melhor pra fazer além de seguir uma voz misteriosa até uma ilha no norte da europa e evitar serem comidos pelos monstros no caminho.

Em uma megalópole destruída pela ganância dos seres humanos, um trio de jovens tenta sobreviver ás sombras vivas conhecidas como Devoradores. Eles achavam que toda a esperança estavam perdidas, até descobrirem que há uma forma de sair de Etheral City, mas para isso, eles terão que encontrar as páginas perdidas do manuscrito das Artes Proibidas.

Denki, May, Clara e Fuusuke viviam em Tokyo. Mas como todo anime ou fic baseado em shounen, eles tem poderes especiais. Muito mais que técnicas de futebol ou magias, eles dominam a Psynergia - a energia dos quatro elementos que formam o mundo em que vivemos.
E é com o poder dos elementos que eles sobreviverão a perigosas aventuras, matando monstros, pegando monstros, derrotando criaturas poderosas, visitando lugares do mundo todo... e explodindo coisas, é claro!
Midnight Hunters! Porque depois da meia-noite, tudo pode acontecer!

[Editado pela moderação]

Na cidade conhecida como Lavender, os vários tipos de espíritos viviam em paz, se escondendo dos humanos. O Fantasma da Meia Noite, que se parecia um rapaz gótico de 17 anos, descobre que alguns fantasmas podem absorver poderes de outros. Em sua jornada para assimilar os poderes dos outros, ele acaba salvando Falcis de um Poltergeist, mas acaba descobrindo que a garota é uma Necromante. Sua mãe á interna por achar que ela tem problemas, e o Fantasmada da Meia Noite se sente culpado e vai tirá-la de lá. Após isso, eles começam a se tornar grandes amigos... ou mais do que isso.