Konoha, uma grande metrópole com seus arranha-céus enormes com grandes paredes de vidros a perder de vista e com diversos pontos turísticos de tirar o fôlego de qualquer pessoa, é também o lar que abriga os maiores conglomerados empresariais de todos os tempos e que buscavam a supremacia dos negócios de toda a cidade, Os Hyuugas, os Uchihas e os Otsutsukis.
Após ataques constantes de robôs desconhecidos a pontos estratégicos da cidade, uma figura misteriosa que age nas sombras conhecida como a Princesa do Byakugan, se levanta contra essas máquinas assassinas para acabar com os planos de diversas facções criminosas como a Akatsuki e a gangue da Serpente, chefiada por um homem sem escrúpulos de nome Orochimaru.
Entretanto, durante uma batalha da Princesa do Byakugan num velho complexo industrial abandonado contra um robô de origem desconhecida, lá ela é ajudada por um rapaz que estava praticamente no lugar errado, na hora errada, ao término da luta, o garoto é ferido mortalmente e graças as mais altas experiências tecnológicas, mais tarde ele será o herói conhecido como Raposa Escarlate.