Houve uma Guerra Santa travada entre Athena e Hades que antecedeu a sangrenta batalha do Lost Canvas. Desta guerra apenas dois irmãos sobreviveram, herdando de sua Athena a missão de reerguer o santuário e guiar a geração futura em direção a justiça e a paz. Eram Sage e Hakurei.
Mas antes de receber tal herança da deusa, os irmãos enfrentaram batalhas duras e sangrentas, derrotaram inimigos poderosos e viram suas mãos sob o sangue de grandes amigos.
Um santuário que se partiria em dois é o cenário que ilustra a Guerra Santa de 1503...